Su familia procede de
Cantabria (
España). En
2002, el
Club Bella Vista, con el jugador en sus filas, termina segundo en la zona sur del
Torneo Argentino B. Su club obtiene el derecho de participar de un repechaje para ascender contra
Cipolletti y los rionegrinos se mantienen en su categoría ganando en los penales.
Rápidamente, ficha por
Huracán de Tres Arroyos y juega 53 partidos, marcando 15 goles. A principios de
2004 viaja a
Europa para incorporarse a una filial del
Real Betis en el ascenso español, estando quince días de prueba y cumpliendo con las expectativas del club. Le solicitaron que volviera en junio de ese año, pero surgió la propuesta de
Banfield y no regresó nunca más y despues se va al Club de
La Boca donde fue figura marcando muchos goles y saliendo campeon.En su mejor momento de su ciclo en el Club de
La Boca la Lazio de Italia llego a ofrecer un monto cercano a los 20.000.000 de Euros pero el club lo rechazo porque Palacio preferia ir a un club español. En la temporada 08/09 casi no jugo debido a sus lesiones y de ahi se fue al
Genoa donde marco goles con menor frecuencia.
En el verano de
2005 fue incorporado al
Boca Juniors, convirtiéndose rápidamente en figura del club.
Rodrigo celebra un gol con
Martín Palermo. Boca Juniors vs Velez Sarsfield. 1-Oct-2006.
Pese a no tener un primer semestre positivo, en la segunda mitad del año su habilidad y goles fueron fundamentales para que el equipo consiguiera el
Torneo Apertura y la
Copa Sudamericana de 2005. Además de formar el plantel que obtuvo la
Recopa Sudamericana 2005. El año siguiente, brilló con goles para la consagración de su equipo en la obtención del campeonato de
Torneo Clausura 2006, convirtiendo un gol importante en el último partido frente a
Independiente. En septiembre convirtió tres goles para la obtención de la
Recopa Sudamericana 2006 ante el
São Paulo brasileño, dos de local y uno importante de visita ante un resultado que dejaba fuera al conjunto argentino. Al siguiente año ganó la
Copa Libertadores 2007, torneo en el que junto a
Riquelme y
Palermo fue desbordante en todos los partidos de la competición donde marcó importantes goles, como el primero en el partido de ida de la final en
La Bombonera frente al
Grêmio brasileño, encuentro en el cual Boca obtuvo una gran ventaja de 3-0.
Durante la segunda mitad de
2007 ni él ni el equipo tuvieron una actuación sobresaliente, pero al menos pudo ser la figura del subcampeonato del mundo obtenido en la final del
Mundial de Clubes Japón 2007, al convertir el empate transitorio 1-1 ante el
Milan italiano. También estuvo entre los tres mejores de la competición por ganarse el balón de bronce, compartiendo podio con el brasileño
Kaká (
jugador FIFA de ese año) y el
neerlandés Clarence Seedorf.
En
2008 obtuvo la
Recopa Sudamericana, contribuyendo con dos goles repartidos en el partido de ida y otro en el de vuelta. A pesar de una pubialgia que lo marginó de las canchas gran parte del segundo semestre de este año, logró concretar unos minutos en los últimos partidos, volviendo a mostrar algunos destellos de su nivel. Se proclamó campeón del
Torneo Apertura 2008 colaborando con un gol importante ante
San Lorenzo en el triangular de dicho torneo con el gol del 2-1 (3-1 final) luego de una serie de pases.
En julio de
2009 el
Genoa italiano lo ficha por 4,5 millones de euros.
